Un agent pathogène émergent à l’origine de cas d’aspergillose identifié au Japon

Cette espèce fongique, hybride allodiploïde issue de A. spinulosporus et A. sublatus, avait déjà été associée à des cas d’aspergillose pulmonaire invasive en Europe et aux États-Unis, mais n’avait encore jamais été documentée au Japon.

Grâce à des analyses phylogénétiques du gène de la calmoduline et à un séquençage génomique complet, l’équipe a pu distinguer sept souches de A. latus parmi 23 isolats collectés entre 2012 et 2023. La nature hybride de ce champignon explique la présence de doubles allèles et de signatures génétiques issues des deux espèces parentales. Les souches identifiées ont par ailleurs montré une sensibilité réduite au caspofungine et à l’amphotéricine B, en partie expliquée par des mutations spécifiques dans le gène fks1, impliqué dans la résistance aux échinocandines.

Ces résultats soulignent l’importance du recours à des outils de diagnostic moléculaire pour identifier les espèces cryptiques d’Aspergillus, difficiles à différencier sur le seul plan morphologique. Les auteurs plaident pour l’intégration d’analyses phylogénétiques et génomiques dans les systèmes de diagnostic de routine, afin de permettre une prise en charge antifongique adaptée en cas d’infection par des souches hybrides comme A. latus.